Въпреки това, заедно с типична картина, в някои случаи, ние откриваме малки отклонения от нея, отличителна особеност на която е тенденцията на паразита да проникне в дълбоките слоеве на чревната стена, а именно в subepithelial тъкан. В perforans Eimeria, обикновено паразитни в епитела на тънките "чревната един заек, с лоша инфекция на паразит прониква в subepithelial съединителната тъкан на въси. Този метод на развитие се превръща в редовно събитие в sulepithelialis Eimeria, sporogony който винаги възниква в subepithelial тъкан. По същия начин може да се види в кокцидийните род Isospora, паразити при котки и кучета. ISO-spora Felis parasitizes изключително в епителните клетки на червата на котка и никога не се получава под епитела. Другите кокцидии котка, Isospora Риволта, хронични инфекции понякога могат да се видят в ооцисти subepithelial тъкан на червата.
