Набагато важче навіть приблизно підрахувати кількість паразитичних Mastigophora. Паразитичні жгутіконосци є, перш за все, в загоні Peridinea (рис. 30). IIIaTTOH (Chatton, 1919) дає список в 43 типових паразитичних Peridinea і представників роду Haplozoon, описаного Догеля і належить до того ж загону. В даний час можна вважати число відомих паразитичних Peridinea що досягли 60 видів. У загоні Euglenoidina паразитування в кишечнику пуголовків констатовано у одного виду Euglena і у Euglenamorpha hegneri (We nri з h, 1926), а також у Hegneria leptodactyli. Загалом паразитичний спосіб життя в загоні Euglenoidina представляє рідкісний виняток.
Навпаки, в загоні Protomonadina паразитизм широко поширений. В е-н і о н (W en у о п, 1926) у своєму великому керівництві призводить близько 300 видів, у тому числі понад 70 видів Trypanosoma. З тих пір кількість описаних форм значно збільшилася, так що для даного загону можна прийняти не менше 350 видів паразитів.
